高邮鸭研究所创办于1994年，是江苏高邮鸭集团的直属科研单位，同时也是全国唯一从事高邮鸭研究的机构。该所现有各类技术人员20多人，其中高级畜牧师4人，畜牧师8人，主要担负着高邮鸭的保种选育和技术推广任务。经过多年的努力，使高邮鸭的生产性能有了明显的提高，“高邮鸭家系选育”、“提高高邮鸭双黄蛋产出率”、“提高蛋黄色素”等课题研究，先后获得了国家农业部、江苏省农林厅及扬州市政府的嘉奖。

高邮鸭由于品种优、效益高，深受广大养殖户的喜爱，我国山东、福建、吉林等二十多个省市和地区，包括菲律宾、坦桑尼亚等国家都曾先后前来引进品种。